Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TK1P04183 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TK1P04183 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TK1P04183 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TK1P04183 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TK1P04183 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TK1P04183 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TK1P04183 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TK1P04183 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TK1P04183 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TK1P04183 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TK1P04183 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms