Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VPREB3Q9UKI3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms