Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEFLP07196 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NEFLP07196 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEFLP07196 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEFLP07196 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms