Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BHMG1C9JSJ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BHMG1C9JSJ3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms