Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRTO14522 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRTO14522 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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