Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CRIP3Q6Q6R5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CRIP3Q6Q6R5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms