Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIF1AQ16665 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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