Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GTF2E1P29083 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GTF2E1P29083 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms