Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q3C1V9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q3C1V9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q3C1V9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q3C1V9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q3C1V9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q3C1V9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms