Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RRN3P1Q2M238 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RRN3P1Q2M238 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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