Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPREB3Q9UKI3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms