Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM106CQ9BVX2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM106CQ9BVX2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms