Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms