Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CRIP3Q6Q6R5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms