Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TK1P04183 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TK1P04183 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TK1P04183 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TK1P04183 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TK1P04183 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TK1P04183 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TK1P04183 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TK1P04183 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TK1P04183 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TK1P04183 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.5 ms