Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 518.71■□□□□ 0.594e-7■■■■■ 42.4
FAM120AQ9NZB2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 42.4
FAM120AQ9NZB2 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 217.15■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 42.4
FAM120AQ9NZB2 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.63■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 42.4
FAM120AQ9NZB2 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.05■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 42.4
FAM120AQ9NZB2 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 214.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 42.4
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 418.91■□□□□ 0.621e-9■■■■■ 42.3
FAM120AQ9NZB2 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 42.2
FAM120AQ9NZB2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 42.1
FAM120AQ9NZB2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 42.1
FAM120AQ9NZB2 SCNN1D-204ENST00000379101 2268 ntTSL 1 (best)16.93■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 42.1
FAM120AQ9NZB2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.136e-7■■■■■ 42.1
FAM120AQ9NZB2 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.296e-7■■■■■ 42.1
FAM120AQ9NZB2 SCNN1D-208ENST00000470022 645 ntTSL 312.8□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 42.1
FAM120AQ9NZB2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.899e-7■■■■■ 41.9
FAM120AQ9NZB2 SDCCAG8-202ENST00000435549 1551 ntTSL 1 (best)14.69□□□□□ -0.069e-7■■■■■ 41.9
FAM120AQ9NZB2 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.319e-7■■■■■ 41.9
FAM120AQ9NZB2 CORO1C-217ENST00000551550 547 ntTSL 410.2□□□□□ -0.783e-10■■■■■ 41.9
FAM120AQ9NZB2 CHID1-212ENST00000528426 991 ntTSL 530.85■■■□□ 2.536e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 CHID1-217ENST00000530939 571 ntTSL 428.75■■■□□ 2.196e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 THOP1-204ENST00000585673 784 ntTSL 326.22■■□□□ 1.792e-9■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.836e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.836e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 CHID1-222ENST00000533059 578 ntTSL 314.79□□□□□ -0.046e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 CHID1-211ENST00000528154 594 ntTSL 414.28□□□□□ -0.126e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 CHID1-208ENST00000525225 523 ntTSL 512.51□□□□□ -0.416e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 412.23□□□□□ -0.456e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 CHID1-209ENST00000525840 438 ntTSL 310.12□□□□□ -0.796e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 CHID1-221ENST00000533056 752 ntTSL 39.88□□□□□ -0.836e-12■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 COL9A3-213ENST00000489045 838 ntTSL 525.06■■□□□ 1.66e-8■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 COL9A3-202ENST00000452372 596 ntTSL 521.28■■□□□ 16e-8■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 COL9A3-204ENST00000463487 760 ntTSL 521.02■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.836e-8■■■■■ 41.8
FAM120AQ9NZB2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.173e-7■■■■■ 41.7
FAM120AQ9NZB2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 41.7
FAM120AQ9NZB2 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 216.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 41.6
FAM120AQ9NZB2 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 41.6
FAM120AQ9NZB2 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 49.95□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 41.6
FAM120AQ9NZB2 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 41.6
FAM120AQ9NZB2 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 41.6
FAM120AQ9NZB2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-207ENST00000597112 1728 ntTSL 217.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-210ENST00000599637 565 ntTSL 416.99■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-216ENST00000602095 617 ntTSL 316.5■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-212ENST00000599980 750 ntTSL 215.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-206ENST00000596966 583 ntTSL 315.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-213ENST00000600924 605 ntTSL 412.17□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-201ENST00000355147 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-204ENST00000594760 549 ntTSL 49.89□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-209ENST00000599247 1926 ntTSL 1 (best)7.62□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 41.5
FAM120AQ9NZB2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 TCF3-218ENST00000593064 2694 ntTSL 216.7■□□□□ 0.266e-9■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 TCF3-217ENST00000592628 1751 ntTSL 516.3■□□□□ 0.26e-9■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.452e-10■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.112e-10■■■■■ 41.4
FAM120AQ9NZB2 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 41.3
FAM120AQ9NZB2 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 41.3
FAM120AQ9NZB2 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-7■■■■■ 41.3
FAM120AQ9NZB2 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 CCT6P3-202ENST00000426828 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-8■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.612e-7■■■■■ 41.1
FAM120AQ9NZB2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.813e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 ZDHHC5-207ENST00000529480 3546 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-201ENST00000366516 1863 ntTSL 1 (best)9.87□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-212ENST00000483072 466 ntTSL 29.39□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.043e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-202ENST00000366517 1372 ntTSL 1 (best)8.26□□□□□ -1.093e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-209ENST00000470510 1042 ntTSL 57.5□□□□□ -1.213e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-217ENST00000493441 823 ntTSL 27.43□□□□□ -1.223e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 SMYD3-215ENST00000490322 368 ntTSL 33.08□□□□□ -1.923e-9■■■■■ 41
FAM120AQ9NZB2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-9■■■■■ 40.9
FAM120AQ9NZB2 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.141e-9■■■■■ 40.9
FAM120AQ9NZB2 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 515.94■□□□□ 0.146e-12■■■■■ 40.9
FAM120AQ9NZB2 CLN6-215ENST00000636674 2005 ntTSL 515.6■□□□□ 0.096e-12■■■■■ 40.9
FAM120AQ9NZB2 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 212.12□□□□□ -0.476e-12■■■■■ 40.9
FAM120AQ9NZB2 RAB21-201ENST00000261263 15546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.958e-8■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.515e-15■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-216ENST00000532373 620 ntTSL 317.59■□□□□ 0.415e-15■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-210ENST00000528357 500 ntTSL 416.93■□□□□ 0.35e-15■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.235e-15■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-205ENST00000526982 965 ntTSL 315.65■□□□□ 0.15e-15■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-213ENST00000530889 563 ntTSL 214.37□□□□□ -0.115e-15■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.285e-15■■■■■ 40.7
FAM120AQ9NZB2 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 223.39■■□□□ 1.332e-11■■■■■ 40.6
FAM120AQ9NZB2 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 40.6
FAM120AQ9NZB2 EMC1-202ENST00000375208 4084 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 40.6
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 324.4 ms