Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-2Q9BYQ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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KRTAP9-2Q9BYQ4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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KRTAP9-2Q9BYQ4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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KRTAP9-2Q9BYQ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-2Q9BYQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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KRTAP9-2Q9BYQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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KRTAP9-2Q9BYQ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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KRTAP9-2Q9BYQ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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KRTAP9-2Q9BYQ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-2Q9BYQ4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-2Q9BYQ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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