Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIC2Q96JB3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIC2Q96JB3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HIC2Q96JB3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIC2Q96JB3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms