Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP3

DNAAF1, Dynein assembly factor 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF1Q8NEP3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF1Q8NEP3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNAAF1Q8NEP3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNAAF1Q8NEP3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAAF1Q8NEP3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms