Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNX31Q8N9S9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNX31Q8N9S9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNX31Q8N9S9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX31Q8N9S9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX31Q8N9S9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms