Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SYCP1Q15431 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYCP1Q15431 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SYCP1Q15431 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SYCP1Q15431 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SYCP1Q15431 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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