Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 POP2YNR052C 1302 nt9.02□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 ELO1YJL196C 933 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 PEX27YOR193W 1131 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 RIM2YBR192W 1134 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 MET30YIL046W 1923 nt9.01□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 SFL1YOR140W 2301 nt9□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 YNL190WYNL190W 615 nt9□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 NAM8YHR086W 1572 nt8.99□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 KEL3YPL263C 1956 nt8.99□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 LSM12YHR121W 564 nt8.99□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 YMR007WYMR007W 381 nt8.99□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 SWT21YNL187W 1074 nt8.99□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 ORT1YOR130C 879 nt8.98□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 HMT1YBR034C 1047 nt8.98□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 THI6YPL214C 1623 nt8.98□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 HTS1YPR033C 1641 nt8.98□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 GTT3YEL017W 1014 nt8.97□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 SDS24YBR214W 1584 nt8.96□□□□□ -0.97
PUS1Q12211 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.96□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 FAR3YMR052W 615 nt8.96□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 RPC31YNL151C 756 nt8.96□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 ITR2YOL103W 1830 nt8.96□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 ADE16YLR028C 1776 nt8.95□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 SRP102YKL154W 735 nt8.95□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 RCR1YBR005W 642 nt8.95□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 snR4snR4 186 nt8.95□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 DPL1YDR294C 1770 nt8.94□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 REX2YLR059C 810 nt8.94□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 ENO1YGR254W 1314 nt8.94□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 LEU4YNL104C 1860 nt8.93□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 LAS17YOR181W 1902 nt8.93□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 snR31snR31 225 nt8.92□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 HAP5YOR358W 729 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 MET1YKR069W 1782 nt8.91□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 NPP2YEL016C 1482 nt8.9□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 YMR265CYMR265C 1386 nt8.9□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 KRR1YCL059C 951 nt8.9□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 URH1YDR400W 1023 nt8.9□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt8.9□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 VMA11YPL234C 495 nt8.9□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 ERO1YML130C 1692 nt8.9□□□□□ -0.98
PUS1Q12211 GCD11YER025W 1584 nt8.9□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 SUV3YPL029W 2214 nt8.89□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 VBA3YCL069W 1377 nt8.89□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 YLR280CYLR280C 351 nt8.89□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 RPN14YGL004C 1254 nt8.88□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 YGR210CYGR210C 1236 nt8.87□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 YKL053WYKL053W 375 nt8.87□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 YLR036CYLR036C 612 nt8.87□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 RUF21RUF21 707 nt8.87□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 HXT11YOL156W 1704 nt8.87□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 SRP54YPR088C 1626 nt8.87□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 TRP2YER090W 1524 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 YEL074WYEL074W 339 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 CRC1YOR100C 984 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 FCY1YPR062W 477 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 PFS2YNL317W 1398 nt8.86□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 ARC19YKL013C 516 nt8.85□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 BUD20YLR074C 501 nt8.85□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 MAM3YOL060C 2121 nt8.85□□□□□ -0.99
PUS1Q12211 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt8.83□□□□□ -1
PUS1Q12211 YEL023CYEL023C 2049 nt8.83□□□□□ -1
PUS1Q12211 UBC12YLR306W 567 nt8.82□□□□□ -1
PUS1Q12211 YPT11YNL304W 1254 nt8.82□□□□□ -1
PUS1Q12211 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.82□□□□□ -1
PUS1Q12211 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.82□□□□□ -1
PUS1Q12211 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.82□□□□□ -1
PUS1Q12211 HSV2YGR223C 1347 nt8.81□□□□□ -1
PUS1Q12211 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.81□□□□□ -1
PUS1Q12211 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.81□□□□□ -1
PUS1Q12211 AIM34YMR003W 597 nt8.81□□□□□ -1
PUS1Q12211 VPS28YPL065W 729 nt8.81□□□□□ -1
PUS1Q12211 SAN1YDR143C 1833 nt8.81□□□□□ -1
PUS1Q12211 YJL045WYJL045W 1905 nt8.8□□□□□ -1
PUS1Q12211 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt8.8□□□□□ -1
PUS1Q12211 YML079WYML079W 606 nt8.8□□□□□ -1
PUS1Q12211 SNX3YOR357C 489 nt8.8□□□□□ -1
PUS1Q12211 YPL108WYPL108W 507 nt8.8□□□□□ -1
PUS1Q12211 SRM1YGL097W 1449 nt8.8□□□□□ -1
PUS1Q12211 PUS9YDL036C 1389 nt8.79□□□□□ -1
PUS1Q12211 YJR154WYJR154W 1041 nt8.79□□□□□ -1
PUS1Q12211 YHM2YMR241W 945 nt8.79□□□□□ -1
PUS1Q12211 YFR020WYFR020W 699 nt8.77□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 IRC14YOR135C 342 nt8.77□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 YDR467CYDR467C 327 nt8.76□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 YJL107CYJL107C 1164 nt8.76□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 YOR343CYOR343C 327 nt8.76□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 FRT1YOR324C 1809 nt8.75□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 KGD2YDR148C 1392 nt8.75□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 STF1YDL130W-A 261 nt8.75□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 GRH1YDR517W 1119 nt8.75□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 YJL160CYJL160C 864 nt8.75□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 MOD5YOR274W 1287 nt8.75□□□□□ -1.01
PUS1Q12211 DIA4YHR011W 1341 nt8.75□□□□□ -1.01
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