Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 YJR149WYJR149W 1215 nt9.35□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 OCH1YGL038C 1443 nt9.34□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 YJL009WYJL009W 327 nt9.34□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 POP2YNR052C 1302 nt9.32□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 HMG2YLR450W 3138 nt9.32□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 RRT14YIL127C 621 nt9.32□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 EMC3YKL207W 762 nt9.32□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 PUS5YLR165C 765 nt9.32□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 AAT1YKL106W 1356 nt9.32□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 TPN1YGL186C 1740 nt9.31□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 BUB2YMR055C 921 nt9.31□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 YMR210WYMR210W 1350 nt9.31□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 PET18YCR020C 648 nt9.3□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.3□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 FHN1YGR131W 525 nt9.3□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 PDC6YGR087C 1692 nt9.29□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 RNA170RNA170 169 nt9.28□□□□□ -0.92
SSF2Q12153 MLS1YNL117W 1665 nt9.27□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 TPO4YOR273C 1980 nt9.27□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 MTO1YGL236C 2010 nt9.26□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 snR86snR86 1004 nt9.24□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 GRH1YDR517W 1119 nt9.24□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 YPT31YER031C 672 nt9.24□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 MFT1YML062C 1179 nt9.24□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 URA8YJR103W 1737 nt9.23□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 RHO1YPR165W 630 nt9.23□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 YPR084WYPR084W 1371 nt9.23□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 YBR056WYBR056W 1506 nt9.22□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 ATG22YCL038C 1587 nt9.22□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 TOM20YGR082W 552 nt9.22□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 YLR122CYLR122C 378 nt9.22□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 MEP1YGR121C 1479 nt9.21□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 MAE1YKL029C 2010 nt9.21□□□□□ -0.93
SSF2Q12153 RMA1YKL132C 1293 nt9.21□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 YMR206WYMR206W 942 nt9.21□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 RPS6AYPL090C 711 nt9.21□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 RPS6BYBR181C 711 nt9.21□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 UTR5YEL035C 501 nt9.2□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 YER156CYER156C 1017 nt9.2□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 BUD20YLR074C 501 nt9.2□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 BXI1YNL305C 894 nt9.2□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 KDX1YKL161C 1302 nt9.2□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 THI73YLR004C 1572 nt9.2□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 IDP3YNL009W 1263 nt9.19□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 TRP2YER090W 1524 nt9.18□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 ARA2YMR041C 1008 nt9.18□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 THI6YPL214C 1623 nt9.16□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 HRA1HRA1 564 nt9.16□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 REC114YMR133W 1287 nt9.16□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 NBA1YOL070C 1506 nt9.15□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 ADA2YDR448W 1305 nt9.15□□□□□ -0.94
SSF2Q12153 MRP1YDR347W 966 nt9.14□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 PUP3YER094C 618 nt9.14□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 YLR173WYLR173W 1827 nt9.14□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 YHR131CYHR131C 2553 nt9.14□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 YOR343CYOR343C 327 nt9.13□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 SHC1YER096W 1539 nt9.13□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 FET5YFL041W 1869 nt9.13□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 GDH1YOR375C 1365 nt9.12□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 BNS1YGR230W 414 nt9.11□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 MGM101YJR144W 810 nt9.11□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 HDA1YNL021W 2121 nt9.1□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 EHT1YBR177C 1356 nt9.1□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.09□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 ATP2YJR121W 1536 nt9.09□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 ELP4YPL101W 1371 nt9.09□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 SNU66YOR308C 1764 nt9.09□□□□□ -0.95
SSF2Q12153 HXT11YOL156W 1704 nt9.08□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 LRO1YNR008W 1986 nt9.08□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 TAD2YJL035C 753 nt9.08□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 TDH1YJL052W 999 nt9.08□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 ATG17YLR423C 1254 nt9.08□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 INO1YJL153C 1602 nt9.07□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 RCF1YML030W 480 nt9.07□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 PRE10YOR362C 867 nt9.07□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 YHL008CYHL008C 1884 nt9.06□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 YIL168WYIL168W 384 nt9.06□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 HIS3YOR202W 663 nt9.06□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 YLR072WYLR072W 2082 nt9.06□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 NDE2YDL085W 1638 nt9.05□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.05□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 NSG2YNL156C 900 nt9.05□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 LEA1YPL213W 717 nt9.05□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 JHD1YER051W 1479 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 BUD31YCR063W 474 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 PMU1YKL128C 888 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 REG2YBR050C 1017 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 HXT8YJL214W 1710 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 TIM50YPL063W 1431 nt9.04□□□□□ -0.96
SSF2Q12153 YGR137WYGR137W 375 nt9.02□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.02□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 SRM1YGL097W 1449 nt9.02□□□□□ -0.97
SSF2Q12153 RPL12BYDR418W 498 nt9.01□□□□□ -0.97
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