Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

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Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 UME1YPL139C 1383 nt11.64□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 SSL2YIL143C 2532 nt11.63□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 SLM3YDL033C 1254 nt11.63□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt11.62□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 YJL144WYJL144W 315 nt11.62□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 PNS1YOR161C 1620 nt11.61□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 LAT1YNL071W 1449 nt11.61□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 PUP3YER094C 618 nt11.6□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 ATP23YNR020C 813 nt11.6□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 YOR111WYOR111W 699 nt11.6□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 DPL1YDR294C 1770 nt11.6□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 DOC1YGL240W 753 nt11.59□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 ESBP6YNL125C 2022 nt11.59□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 GGA2YHR108W 1758 nt11.58□□□□□ -0.55
GDB1Q06625 YOX1YML027W 1158 nt11.57□□□□□ -0.56
GDB1Q06625 CPT1YNL130C 1182 nt11.57□□□□□ -0.56
GDB1Q06625 GPM1YKL152C 744 nt11.55□□□□□ -0.56
GDB1Q06625 ODC1YPL134C 933 nt11.55□□□□□ -0.56
GDB1Q06625 MEP1YGR121C 1479 nt11.53□□□□□ -0.56
GDB1Q06625 YBL111CYBL111C 2004 nt11.53□□□□□ -0.56
GDB1Q06625 JHD1YER051W 1479 nt11.52□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 YJL009WYJL009W 327 nt11.5□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 CWP2YKL096W-A 279 nt11.5□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 YDR467CYDR467C 327 nt11.48□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 PUS4YNL292W 1212 nt11.48□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 YIR035CYIR035C 765 nt11.47□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 AAC3YBR085W 924 nt11.47□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 TMS1YDR105C 1422 nt11.47□□□□□ -0.57
GDB1Q06625 SPE3YPR069C 882 nt11.45□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 TIM50YPL063W 1431 nt11.45□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 BUB2YMR055C 921 nt11.45□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 LEU4YNL104C 1860 nt11.44□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 AIM46YHR199C 933 nt11.43□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 CST26YBR042C 1194 nt11.43□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 HXT8YJL214W 1710 nt11.43□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.42□□□□□ -0.58
GDB1Q06625 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt11.4□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt11.4□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 HIS2YFR025C 1008 nt11.39□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 PMU1YKL128C 888 nt11.39□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 PRE10YOR362C 867 nt11.39□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 POR2YIL114C 846 nt11.38□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 YBR056WYBR056W 1506 nt11.37□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 ZIM17YNL310C 525 nt11.35□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 TRR2YHR106W 1029 nt11.35□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 ADH6YMR318C 1083 nt11.35□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 YHR218WYHR218W 1812 nt11.34□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 AVO2YMR068W 1281 nt11.34□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 YPQ1YOL092W 927 nt11.34□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 MBF1YOR298C-A 456 nt11.34□□□□□ -0.59
GDB1Q06625 GAL83YER027C 1254 nt11.33□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 CRN1YLR429W 1956 nt11.32□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 YMC2YBR104W 990 nt11.31□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 PLB3YOL011W 2061 nt11.3□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 MDM35YKL053C-A 261 nt11.3□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 PMP3YDR276C 168 nt11.29□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 MRS4YKR052C 915 nt11.29□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 MCP1YOR228C 909 nt11.28□□□□□ -0.6
GDB1Q06625 YGL081WYGL081W 963 nt11.27□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 LRO1YNR008W 1986 nt11.27□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 RIM8YGL045W 1629 nt11.26□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 HSL7YBR133C 2484 nt11.25□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 snR86snR86 1004 nt11.25□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 YJR142WYJR142W 1029 nt11.25□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 NPP2YEL016C 1482 nt11.25□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 YMR209CYMR209C 1374 nt11.25□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 CKI1YLR133W 1749 nt11.25□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 AAT1YKL106W 1356 nt11.24□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 TPN1YGL186C 1740 nt11.24□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 NMA2YGR010W 1188 nt11.24□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 PTH2YBL057C 627 nt11.23□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 CDC3YLR314C 1563 nt11.22□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 PDA1YER178W 1263 nt11.22□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 LDB7YBL006C 543 nt11.22□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 RCF1YML030W 480 nt11.22□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 YML034C-AYML034C-A 399 nt11.22□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 ARG7YMR062C 1326 nt11.22□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 KRR1YCL059C 951 nt11.21□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 PRS4YBL068W 981 nt11.21□□□□□ -0.61
GDB1Q06625 BIO3YNR058W 1443 nt11.2□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 ARO3YDR035W 1113 nt11.19□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 LGE1YPL055C 999 nt11.19□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 YPL067CYPL067C 597 nt11.19□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 ERV2YPR037C 591 nt11.19□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 SPS1YDR523C 1473 nt11.18□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 YER152CYER152C 1332 nt11.17□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 MSI1YBR195C 1269 nt11.17□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 EHT1YBR177C 1356 nt11.16□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 MPH3YJR160C 1809 nt11.16□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 PSA1YDL055C 1086 nt11.16□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 TES1YJR019C 1050 nt11.16□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 ALG7YBR243C 1347 nt11.16□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 HXT10YFL011W 1641 nt11.15□□□□□ -0.62
GDB1Q06625 OSM1YJR051W 1506 nt11.14□□□□□ -0.63
GDB1Q06625 YLR184WYLR184W 348 nt11.14□□□□□ -0.63
GDB1Q06625 AAD14YNL331C 1131 nt11.14□□□□□ -0.63
GDB1Q06625 AGP3YFL055W 1677 nt11.13□□□□□ -0.63
GDB1Q06625 STS1YIR011C 960 nt11.13□□□□□ -0.63
GDB1Q06625 DIP5YPL265W 1827 nt11.13□□□□□ -0.63
GDB1Q06625 CYS4YGR155W 1524 nt11.12□□□□□ -0.63
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