Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 SLM3YDL033C 1254 nt11.84□□□□□ -0.51
SNT2P53127 CYS3YAL012W 1185 nt11.84□□□□□ -0.51
SNT2P53127 UGP1YKL035W 1500 nt11.83□□□□□ -0.51
SNT2P53127 YDR467CYDR467C 327 nt11.83□□□□□ -0.52
SNT2P53127 YJL144WYJL144W 315 nt11.83□□□□□ -0.52
SNT2P53127 PUP3YER094C 618 nt11.82□□□□□ -0.52
SNT2P53127 YJL009WYJL009W 327 nt11.82□□□□□ -0.52
SNT2P53127 JHD1YER051W 1479 nt11.82□□□□□ -0.52
SNT2P53127 LAT1YNL071W 1449 nt11.82□□□□□ -0.52
SNT2P53127 YOX1YML027W 1158 nt11.81□□□□□ -0.52
SNT2P53127 ESBP6YNL125C 2022 nt11.81□□□□□ -0.52
SNT2P53127 DPL1YDR294C 1770 nt11.81□□□□□ -0.52
SNT2P53127 UME1YPL139C 1383 nt11.81□□□□□ -0.52
SNT2P53127 SPR1YOR190W 1338 nt11.8□□□□□ -0.52
SNT2P53127 MEP1YGR121C 1479 nt11.79□□□□□ -0.52
SNT2P53127 SSL2YIL143C 2532 nt11.78□□□□□ -0.52
SNT2P53127 PIH1YHR034C 1035 nt11.76□□□□□ -0.53
SNT2P53127 BUB2YMR055C 921 nt11.76□□□□□ -0.53
SNT2P53127 ODC1YPL134C 933 nt11.75□□□□□ -0.53
SNT2P53127 YBL111CYBL111C 2004 nt11.74□□□□□ -0.53
SNT2P53127 CPT1YNL130C 1182 nt11.74□□□□□ -0.53
SNT2P53127 ATP23YNR020C 813 nt11.74□□□□□ -0.53
SNT2P53127 YIR035CYIR035C 765 nt11.73□□□□□ -0.53
SNT2P53127 UME6YDR207C 2511 nt11.71□□□□□ -0.53
SNT2P53127 LEU4YNL104C 1860 nt11.71□□□□□ -0.54
SNT2P53127 HXT8YJL214W 1710 nt11.71□□□□□ -0.54
SNT2P53127 TMS1YDR105C 1422 nt11.7□□□□□ -0.54
SNT2P53127 TIM50YPL063W 1431 nt11.7□□□□□ -0.54
SNT2P53127 AAC3YBR085W 924 nt11.7□□□□□ -0.54
SNT2P53127 YMC2YBR104W 990 nt11.7□□□□□ -0.54
SNT2P53127 CMP2YML057W 1815 nt11.7□□□□□ -0.54
SNT2P53127 PUS4YNL292W 1212 nt11.69□□□□□ -0.54
SNT2P53127 AIM46YHR199C 933 nt11.68□□□□□ -0.54
SNT2P53127 HIS2YFR025C 1008 nt11.67□□□□□ -0.54
SNT2P53127 PRE10YOR362C 867 nt11.67□□□□□ -0.54
SNT2P53127 CWP2YKL096W-A 279 nt11.66□□□□□ -0.54
SNT2P53127 YHR218WYHR218W 1812 nt11.65□□□□□ -0.54
SNT2P53127 POR2YIL114C 846 nt11.65□□□□□ -0.54
SNT2P53127 MRS4YKR052C 915 nt11.64□□□□□ -0.55
SNT2P53127 SPE3YPR069C 882 nt11.64□□□□□ -0.55
SNT2P53127 YBR056WYBR056W 1506 nt11.62□□□□□ -0.55
SNT2P53127 PMU1YKL128C 888 nt11.61□□□□□ -0.55
SNT2P53127 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt11.6□□□□□ -0.55
SNT2P53127 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt11.6□□□□□ -0.55
SNT2P53127 GAL83YER027C 1254 nt11.59□□□□□ -0.55
SNT2P53127 MCP1YOR228C 909 nt11.59□□□□□ -0.55
SNT2P53127 TPN1YGL186C 1740 nt11.56□□□□□ -0.56
SNT2P53127 TRR2YHR106W 1029 nt11.55□□□□□ -0.56
SNT2P53127 LRO1YNR008W 1986 nt11.55□□□□□ -0.56
SNT2P53127 AVO2YMR068W 1281 nt11.54□□□□□ -0.56
SNT2P53127 ZIM17YNL310C 525 nt11.54□□□□□ -0.56
SNT2P53127 CST26YBR042C 1194 nt11.54□□□□□ -0.56
SNT2P53127 AAT1YKL106W 1356 nt11.54□□□□□ -0.56
SNT2P53127 MBF1YOR298C-A 456 nt11.53□□□□□ -0.56
SNT2P53127 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.52□□□□□ -0.56
SNT2P53127 ADH6YMR318C 1083 nt11.52□□□□□ -0.56
SNT2P53127 YPQ1YOL092W 927 nt11.52□□□□□ -0.56
SNT2P53127 PLB3YOL011W 2061 nt11.52□□□□□ -0.56
SNT2P53127 CRN1YLR429W 1956 nt11.52□□□□□ -0.57
SNT2P53127 snR86snR86 1004 nt11.52□□□□□ -0.57
SNT2P53127 YML034C-AYML034C-A 399 nt11.52□□□□□ -0.57
SNT2P53127 MDM35YKL053C-A 261 nt11.51□□□□□ -0.57
SNT2P53127 NPP2YEL016C 1482 nt11.5□□□□□ -0.57
SNT2P53127 KRR1YCL059C 951 nt11.5□□□□□ -0.57
SNT2P53127 YJR142WYJR142W 1029 nt11.5□□□□□ -0.57
SNT2P53127 CKI1YLR133W 1749 nt11.49□□□□□ -0.57
SNT2P53127 NMA2YGR010W 1188 nt11.48□□□□□ -0.57
SNT2P53127 LGE1YPL055C 999 nt11.47□□□□□ -0.57
SNT2P53127 ARG7YMR062C 1326 nt11.47□□□□□ -0.57
SNT2P53127 EHT1YBR177C 1356 nt11.47□□□□□ -0.57
SNT2P53127 YGL081WYGL081W 963 nt11.45□□□□□ -0.58
SNT2P53127 RCF1YML030W 480 nt11.45□□□□□ -0.58
SNT2P53127 ERV2YPR037C 591 nt11.45□□□□□ -0.58
SNT2P53127 PMP3YDR276C 168 nt11.44□□□□□ -0.58
SNT2P53127 PTH2YBL057C 627 nt11.43□□□□□ -0.58
SNT2P53127 CDC3YLR314C 1563 nt11.42□□□□□ -0.58
SNT2P53127 YLR184WYLR184W 348 nt11.42□□□□□ -0.58
SNT2P53127 INO1YJL153C 1602 nt11.41□□□□□ -0.58
SNT2P53127 YPL067CYPL067C 597 nt11.41□□□□□ -0.58
SNT2P53127 OSM1YJR051W 1506 nt11.4□□□□□ -0.58
SNT2P53127 PSA1YDL055C 1086 nt11.4□□□□□ -0.58
SNT2P53127 PDA1YER178W 1263 nt11.4□□□□□ -0.58
SNT2P53127 PRS4YBL068W 981 nt11.4□□□□□ -0.58
SNT2P53127 SPS1YDR523C 1473 nt11.39□□□□□ -0.59
SNT2P53127 BIO3YNR058W 1443 nt11.39□□□□□ -0.59
SNT2P53127 TES1YJR019C 1050 nt11.39□□□□□ -0.59
SNT2P53127 AAD14YNL331C 1131 nt11.39□□□□□ -0.59
SNT2P53127 ALG7YBR243C 1347 nt11.38□□□□□ -0.59
SNT2P53127 AGP3YFL055W 1677 nt11.38□□□□□ -0.59
SNT2P53127 STS1YIR011C 960 nt11.37□□□□□ -0.59
SNT2P53127 LDB7YBL006C 543 nt11.37□□□□□ -0.59
SNT2P53127 YMR209CYMR209C 1374 nt11.37□□□□□ -0.59
SNT2P53127 MSI1YBR195C 1269 nt11.36□□□□□ -0.59
SNT2P53127 HXT10YFL011W 1641 nt11.36□□□□□ -0.59
SNT2P53127 MPH3YJR160C 1809 nt11.36□□□□□ -0.59
SNT2P53127 CYS4YGR155W 1524 nt11.35□□□□□ -0.59
SNT2P53127 YER152CYER152C 1332 nt11.35□□□□□ -0.59
SNT2P53127 ARO3YDR035W 1113 nt11.34□□□□□ -0.59
SNT2P53127 SNP1YIL061C 903 nt11.34□□□□□ -0.59
SNT2P53127 DIP5YPL265W 1827 nt11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 246.5 ms