Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 ERO1YML130C 1692 nt8.07□□□□□ -1.12
SEC28P40509 YIL177CYIL177C 5277 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC28P40509 MDL2YPL270W 2322 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC28P40509 PAU19YMR325W 375 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC28P40509 YMR210WYMR210W 1350 nt8.06□□□□□ -1.12
SEC28P40509 ORT1YOR130C 879 nt8.05□□□□□ -1.12
SEC28P40509 MEP1YGR121C 1479 nt8.05□□□□□ -1.12
SEC28P40509 SER2YGR208W 930 nt8.03□□□□□ -1.12
SEC28P40509 ECM10YEL030W 1935 nt8.03□□□□□ -1.12
SEC28P40509 MEX67YPL169C 1800 nt8.03□□□□□ -1.12
SEC28P40509 SRM1YGL097W 1449 nt8.03□□□□□ -1.12
SEC28P40509 LEA1YPL213W 717 nt8.02□□□□□ -1.13
SEC28P40509 YBR056WYBR056W 1506 nt8.02□□□□□ -1.13
SEC28P40509 HBS1YKR084C 1836 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC28P40509 HTS1YPR033C 1641 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC28P40509 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC28P40509 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC28P40509 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.01□□□□□ -1.13
SEC28P40509 HIS3YOR202W 663 nt8□□□□□ -1.13
SEC28P40509 NDE2YDL085W 1638 nt8□□□□□ -1.13
SEC28P40509 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 YGR210CYGR210C 1236 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 MET22YOL064C 1074 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 FCY1YPR062W 477 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 YLR072WYLR072W 2082 nt7.99□□□□□ -1.13
SEC28P40509 INO1YJL153C 1602 nt7.98□□□□□ -1.13
SEC28P40509 YMR166CYMR166C 1107 nt7.97□□□□□ -1.13
SEC28P40509 LSP1YPL004C 1026 nt7.96□□□□□ -1.14
SEC28P40509 snR4snR4 186 nt7.96□□□□□ -1.14
SEC28P40509 LPD1YFL018C 1500 nt7.96□□□□□ -1.14
SEC28P40509 FTH1YBR207W 1398 nt7.96□□□□□ -1.14
SEC28P40509 OCH1YGL038C 1443 nt7.95□□□□□ -1.14
SEC28P40509 ABP1YCR088W 1779 nt7.94□□□□□ -1.14
SEC28P40509 YEL023CYEL023C 2049 nt7.93□□□□□ -1.14
SEC28P40509 PDC6YGR087C 1692 nt7.93□□□□□ -1.14
SEC28P40509 CAK1YFL029C 1107 nt7.93□□□□□ -1.14
SEC28P40509 YGR137WYGR137W 375 nt7.93□□□□□ -1.14
SEC28P40509 YNL140CYNL140C 570 nt7.93□□□□□ -1.14
SEC28P40509 RHO1YPR165W 630 nt7.93□□□□□ -1.14
SEC28P40509 BUD31YCR063W 474 nt7.92□□□□□ -1.14
SEC28P40509 YPT31YER031C 672 nt7.92□□□□□ -1.14
SEC28P40509 NAS6YGR232W 687 nt7.92□□□□□ -1.14
SEC28P40509 RNA170RNA170 169 nt7.92□□□□□ -1.14
SEC28P40509 YPL108WYPL108W 507 nt7.92□□□□□ -1.14
SEC28P40509 THI73YLR004C 1572 nt7.92□□□□□ -1.14
SEC28P40509 TIF3YPR163C 1311 nt7.91□□□□□ -1.14
SEC28P40509 SAM50YNL026W 1455 nt7.9□□□□□ -1.14
SEC28P40509 INM1YHR046C 888 nt7.9□□□□□ -1.14
SEC28P40509 TDA4YJR116W 840 nt7.9□□□□□ -1.14
SEC28P40509 RCF1YML030W 480 nt7.9□□□□□ -1.14
SEC28P40509 PUP1YOR157C 786 nt7.9□□□□□ -1.14
SEC28P40509 EHT1YBR177C 1356 nt7.89□□□□□ -1.15
SEC28P40509 TGL5YOR081C 2250 nt7.89□□□□□ -1.15
SEC28P40509 YCP4YCR004C 744 nt7.89□□□□□ -1.15
SEC28P40509 RRT14YIL127C 621 nt7.89□□□□□ -1.15
SEC28P40509 SLG1YOR008C 1137 nt7.89□□□□□ -1.15
SEC28P40509 CBK1YNL161W 2271 nt7.89□□□□□ -1.15
SEC28P40509 NME1NME1 340 nt7.88□□□□□ -1.15
SEC28P40509 LRO1YNR008W 1986 nt7.88□□□□□ -1.15
SEC28P40509 WSC3YOL105C 1671 nt7.86□□□□□ -1.15
SEC28P40509 YHR131CYHR131C 2553 nt7.86□□□□□ -1.15
SEC28P40509 DIA4YHR011W 1341 nt7.86□□□□□ -1.15
SEC28P40509 GLY1YEL046C 1164 nt7.86□□□□□ -1.15
SEC28P40509 PUP3YER094C 618 nt7.86□□□□□ -1.15
SEC28P40509 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.86□□□□□ -1.15
SEC28P40509 MGM101YJR144W 810 nt7.86□□□□□ -1.15
SEC28P40509 YMR007WYMR007W 381 nt7.85□□□□□ -1.15
SEC28P40509 MRP7YNL005C 1116 nt7.85□□□□□ -1.15
SEC28P40509 RCR1YBR005W 642 nt7.85□□□□□ -1.15
SEC28P40509 MLS1YNL117W 1665 nt7.85□□□□□ -1.15
SEC28P40509 YJL045WYJL045W 1905 nt7.84□□□□□ -1.15
SEC28P40509 YMR206WYMR206W 942 nt7.84□□□□□ -1.15
SEC28P40509 ADE16YLR028C 1776 nt7.83□□□□□ -1.16
SEC28P40509 YPR084WYPR084W 1371 nt7.83□□□□□ -1.16
SEC28P40509 STF1YDL130W-A 261 nt7.82□□□□□ -1.16
SEC28P40509 MRN1YPL184C 1839 nt7.82□□□□□ -1.16
SEC28P40509 ECM27YJR106W 2178 nt7.81□□□□□ -1.16
SEC28P40509 DIP5YPL265W 1827 nt7.81□□□□□ -1.16
SEC28P40509 PAB1YER165W 1734 nt7.81□□□□□ -1.16
SEC28P40509 SHC1YER096W 1539 nt7.8□□□□□ -1.16
SEC28P40509 SWM1YDR260C 513 nt7.8□□□□□ -1.16
SEC28P40509 PRE10YOR362C 867 nt7.8□□□□□ -1.16
SEC28P40509 GUT1YHL032C 2130 nt7.79□□□□□ -1.16
SEC28P40509 KTR4YBR199W 1395 nt7.79□□□□□ -1.16
SEC28P40509 MET8YBR213W 825 nt7.78□□□□□ -1.16
SEC28P40509 HXT8YJL214W 1710 nt7.78□□□□□ -1.16
SEC28P40509 ARO3YDR035W 1113 nt7.77□□□□□ -1.17
SEC28P40509 UFD1YGR048W 1086 nt7.77□□□□□ -1.17
SEC28P40509 POP2YNR052C 1302 nt7.77□□□□□ -1.17
SEC28P40509 PET18YCR020C 648 nt7.76□□□□□ -1.17
SEC28P40509 SNP1YIL061C 903 nt7.76□□□□□ -1.17
SEC28P40509 YJL160CYJL160C 864 nt7.76□□□□□ -1.17
SEC28P40509 RPS6AYPL090C 711 nt7.76□□□□□ -1.17
SEC28P40509 RPS6BYBR181C 711 nt7.76□□□□□ -1.17
SEC28P40509 DUS3YLR401C 2007 nt7.76□□□□□ -1.17
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