Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 SSL2YIL143C 2532 nt10.3□□□□□ -0.76
YRF1-2P40105 PSP2YML017W 1782 nt10.3□□□□□ -0.76
YRF1-2P40105 PUS4YNL292W 1212 nt10.29□□□□□ -0.76
YRF1-2P40105 SPE3YPR069C 882 nt10.28□□□□□ -0.76
YRF1-2P40105 YPT31YER031C 672 nt10.28□□□□□ -0.76
YRF1-2P40105 RHO1YPR165W 630 nt10.28□□□□□ -0.76
YRF1-2P40105 YBL111CYBL111C 2004 nt10.28□□□□□ -0.76
YRF1-2P40105 ODC1YPL134C 933 nt10.27□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 GGA2YHR108W 1758 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 GPM1YKL152C 744 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 RNA170RNA170 169 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 PDC6YGR087C 1692 nt10.26□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 CYS3YAL012W 1185 nt10.25□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 CWP2YKL096W-A 279 nt10.25□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 CPT1YNL130C 1182 nt10.22□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 GAL83YER027C 1254 nt10.22□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 CST26YBR042C 1194 nt10.22□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 HSL7YBR133C 2484 nt10.21□□□□□ -0.77
YRF1-2P40105 YDR467CYDR467C 327 nt10.21□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 DOC1YGL240W 753 nt10.21□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 AAC3YBR085W 924 nt10.2□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 UME1YPL139C 1383 nt10.19□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 THI73YLR004C 1572 nt10.19□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 OLA1YBR025C 1185 nt10.18□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 PMP3YDR276C 168 nt10.18□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 POR2YIL114C 846 nt10.18□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 DPL1YDR294C 1770 nt10.17□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 YJL009WYJL009W 327 nt10.16□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 TMS1YDR105C 1422 nt10.16□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 ATP2YJR121W 1536 nt10.16□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 ESBP6YNL125C 2022 nt10.16□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 PUP3YER094C 618 nt10.15□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 HIS2YFR025C 1008 nt10.15□□□□□ -0.78
YRF1-2P40105 PNS1YOR161C 1620 nt10.15□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.12□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.12□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 YIR035CYIR035C 765 nt10.11□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 YMR209CYMR209C 1374 nt10.11□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 MDM35YKL053C-A 261 nt10.1□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 YMC2YBR104W 990 nt10.1□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 LEU4YNL104C 1860 nt10.1□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 PLB3YOL011W 2061 nt10.1□□□□□ -0.79
YRF1-2P40105 ZIM17YNL310C 525 nt10.08□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 MEP1YGR121C 1479 nt10.07□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 RIM8YGL045W 1629 nt10.07□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 BUB2YMR055C 921 nt10.06□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 AIM46YHR199C 933 nt10.06□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 JHD1YER051W 1479 nt10.05□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 MRS4YKR052C 915 nt10.05□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 YMR074CYMR074C 438 nt10.04□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 YBR056WYBR056W 1506 nt10.02□□□□□ -0.8
YRF1-2P40105 HXT8YJL214W 1710 nt10.02□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 AIM20YIL158W 615 nt10.02□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 TIM50YPL063W 1431 nt10.01□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 TRR2YHR106W 1029 nt10.01□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 AAT1YKL106W 1356 nt10□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 snR86snR86 1004 nt9.99□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 YHR218WYHR218W 1812 nt9.99□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 PMU1YKL128C 888 nt9.99□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 YPQ1YOL092W 927 nt9.99□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 TPN1YGL186C 1740 nt9.98□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 ADH6YMR318C 1083 nt9.98□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 LDB7YBL006C 543 nt9.97□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 YLR184WYLR184W 348 nt9.96□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 PTH2YBL057C 627 nt9.96□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 AAD14YNL331C 1131 nt9.96□□□□□ -0.81
YRF1-2P40105 NPP2YEL016C 1482 nt9.96□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 MCP1YOR228C 909 nt9.95□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 CRN1YLR429W 1956 nt9.95□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 YGL081WYGL081W 963 nt9.93□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 YGL114WYGL114W 2178 nt9.93□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 SUN4YNL066W 1263 nt9.93□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 PRE10YOR362C 867 nt9.93□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 YER152CYER152C 1332 nt9.92□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 BIO3YNR058W 1443 nt9.91□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 LRO1YNR008W 1986 nt9.91□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 ARO3YDR035W 1113 nt9.9□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 MBF1YOR298C-A 456 nt9.9□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 ALG7YBR243C 1347 nt9.9□□□□□ -0.82
YRF1-2P40105 KRR1YCL059C 951 nt9.9□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 BUD31YCR063W 474 nt9.9□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 PRS4YBL068W 981 nt9.9□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 MPH3YJR160C 1809 nt9.89□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 RCF1YML030W 480 nt9.89□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 AGP3YFL055W 1677 nt9.88□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 CYS4YGR155W 1524 nt9.88□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 HXT10YFL011W 1641 nt9.88□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 PSD1YNL169C 1503 nt9.86□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 CDC3YLR314C 1563 nt9.86□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 PDA1YER178W 1263 nt9.86□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 CKI1YLR133W 1749 nt9.85□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 LGE1YPL055C 999 nt9.85□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 YLR030WYLR030W 792 nt9.84□□□□□ -0.83
YRF1-2P40105 YML034C-AYML034C-A 399 nt9.83□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 MTO1YGL236C 2010 nt9.83□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 DMA2YNL116W 1569 nt9.83□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 IMD1YAR073W 1212 nt9.83□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 ERG10YPL028W 1197 nt9.83□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 ARG7YMR062C 1326 nt9.82□□□□□ -0.84
YRF1-2P40105 DIP5YPL265W 1827 nt9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47 ms