Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 MDL2YPL270W 2322 nt8.62□□□□□ -1.03
VFA1P40080 EHT1YBR177C 1356 nt8.61□□□□□ -1.03
VFA1P40080 PDC6YGR087C 1692 nt8.6□□□□□ -1.03
VFA1P40080 MRN1YPL184C 1839 nt8.6□□□□□ -1.03
VFA1P40080 YGR210CYGR210C 1236 nt8.6□□□□□ -1.03
VFA1P40080 NDE2YDL085W 1638 nt8.6□□□□□ -1.03
VFA1P40080 OCH1YGL038C 1443 nt8.6□□□□□ -1.03
VFA1P40080 DIP5YPL265W 1827 nt8.59□□□□□ -1.03
VFA1P40080 HTS1YPR033C 1641 nt8.58□□□□□ -1.04
VFA1P40080 DIA4YHR011W 1341 nt8.58□□□□□ -1.04
VFA1P40080 CAK1YFL029C 1107 nt8.58□□□□□ -1.04
VFA1P40080 YMR166CYMR166C 1107 nt8.58□□□□□ -1.04
VFA1P40080 YNL140CYNL140C 570 nt8.58□□□□□ -1.04
VFA1P40080 RHO1YPR165W 630 nt8.58□□□□□ -1.04
VFA1P40080 TIF3YPR163C 1311 nt8.57□□□□□ -1.04
VFA1P40080 GLY1YEL046C 1164 nt8.57□□□□□ -1.04
VFA1P40080 FCY1YPR062W 477 nt8.57□□□□□ -1.04
VFA1P40080 SHC1YER096W 1539 nt8.56□□□□□ -1.04
VFA1P40080 LSP1YPL004C 1026 nt8.56□□□□□ -1.04
VFA1P40080 TGL5YOR081C 2250 nt8.56□□□□□ -1.04
VFA1P40080 ADE16YLR028C 1776 nt8.56□□□□□ -1.04
VFA1P40080 POP2YNR052C 1302 nt8.55□□□□□ -1.04
VFA1P40080 INM1YHR046C 888 nt8.55□□□□□ -1.04
VFA1P40080 NAP1YKR048C 1254 nt8.55□□□□□ -1.04
VFA1P40080 BSP1YPR171W 1731 nt8.54□□□□□ -1.04
VFA1P40080 THI73YLR004C 1572 nt8.54□□□□□ -1.04
VFA1P40080 YPL108WYPL108W 507 nt8.54□□□□□ -1.04
VFA1P40080 TDA4YJR116W 840 nt8.53□□□□□ -1.04
VFA1P40080 RCF1YML030W 480 nt8.53□□□□□ -1.04
VFA1P40080 WSC4YHL028W 1818 nt8.52□□□□□ -1.04
VFA1P40080 ARO3YDR035W 1113 nt8.52□□□□□ -1.05
VFA1P40080 PUP3YER094C 618 nt8.52□□□□□ -1.05
VFA1P40080 ALG7YBR243C 1347 nt8.52□□□□□ -1.05
VFA1P40080 URA8YJR103W 1737 nt8.51□□□□□ -1.05
VFA1P40080 MRP7YNL005C 1116 nt8.51□□□□□ -1.05
VFA1P40080 HXT8YJL214W 1710 nt8.51□□□□□ -1.05
VFA1P40080 NPP1YCR026C 2229 nt8.5□□□□□ -1.05
VFA1P40080 FIT1YDR534C 1587 nt8.5□□□□□ -1.05
VFA1P40080 PUP1YOR157C 786 nt8.5□□□□□ -1.05
VFA1P40080 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.49□□□□□ -1.05
VFA1P40080 PET18YCR020C 648 nt8.48□□□□□ -1.05
VFA1P40080 SLG1YOR008C 1137 nt8.48□□□□□ -1.05
VFA1P40080 SAM50YNL026W 1455 nt8.48□□□□□ -1.05
VFA1P40080 WSC3YOL105C 1671 nt8.48□□□□□ -1.05
VFA1P40080 SWM1YDR260C 513 nt8.47□□□□□ -1.05
VFA1P40080 RRT14YIL127C 621 nt8.47□□□□□ -1.05
VFA1P40080 MDH2YOL126C 1134 nt8.47□□□□□ -1.05
VFA1P40080 HSV2YGR223C 1347 nt8.46□□□□□ -1.06
VFA1P40080 KTR4YBR199W 1395 nt8.46□□□□□ -1.06
VFA1P40080 YPT31YER031C 672 nt8.45□□□□□ -1.06
VFA1P40080 UFD1YGR048W 1086 nt8.45□□□□□ -1.06
VFA1P40080 PFS2YNL317W 1398 nt8.45□□□□□ -1.06
VFA1P40080 YGR137WYGR137W 375 nt8.44□□□□□ -1.06
VFA1P40080 MTC6YHR151C 1581 nt8.44□□□□□ -1.06
VFA1P40080 SNP1YIL061C 903 nt8.43□□□□□ -1.06
VFA1P40080 ELP6YMR312W 822 nt8.43□□□□□ -1.06
VFA1P40080 BXI1YNL305C 894 nt8.43□□□□□ -1.06
VFA1P40080 RPS6AYPL090C 711 nt8.43□□□□□ -1.06
VFA1P40080 RPS6BYBR181C 711 nt8.43□□□□□ -1.06
VFA1P40080 PMT7YDR307W 1989 nt8.41□□□□□ -1.06
VFA1P40080 MET13YGL125W 1803 nt8.41□□□□□ -1.06
VFA1P40080 YCP4YCR004C 744 nt8.41□□□□□ -1.06
VFA1P40080 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.41□□□□□ -1.06
VFA1P40080 YJL160CYJL160C 864 nt8.41□□□□□ -1.06
VFA1P40080 TIM50YPL063W 1431 nt8.38□□□□□ -1.07
VFA1P40080 TPO1YLL028W 1761 nt8.38□□□□□ -1.07
VFA1P40080 MAS1YLR163C 1389 nt8.38□□□□□ -1.07
VFA1P40080 PRE10YOR362C 867 nt8.38□□□□□ -1.07
VFA1P40080 JHD1YER051W 1479 nt8.38□□□□□ -1.07
VFA1P40080 PMT1YDL095W 2454 nt8.36□□□□□ -1.07
VFA1P40080 YER156CYER156C 1017 nt8.35□□□□□ -1.07
VFA1P40080 YMR206WYMR206W 942 nt8.35□□□□□ -1.07
VFA1P40080 UTR5YEL035C 501 nt8.34□□□□□ -1.07
VFA1P40080 YGR139WYGR139W 339 nt8.34□□□□□ -1.07
VFA1P40080 YMR007WYMR007W 381 nt8.34□□□□□ -1.07
VFA1P40080 AVL9YLR114C 2295 nt8.33□□□□□ -1.08
VFA1P40080 SLM3YDL033C 1254 nt8.33□□□□□ -1.08
VFA1P40080 CDA1YLR307W 906 nt8.33□□□□□ -1.08
VFA1P40080 YPR084WYPR084W 1371 nt8.33□□□□□ -1.08
VFA1P40080 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.32□□□□□ -1.08
VFA1P40080 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.32□□□□□ -1.08
VFA1P40080 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.32□□□□□ -1.08
VFA1P40080 DST1YGL043W 930 nt8.32□□□□□ -1.08
VFA1P40080 YIL177CYIL177C 5277 nt8.31□□□□□ -1.08
VFA1P40080 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.31□□□□□ -1.08
VFA1P40080 CKB1YGL019W 837 nt8.31□□□□□ -1.08
VFA1P40080 MNN9YPL050C 1188 nt8.31□□□□□ -1.08
VFA1P40080 ARG7YMR062C 1326 nt8.3□□□□□ -1.08
VFA1P40080 PAB1YER165W 1734 nt8.3□□□□□ -1.08
VFA1P40080 TES1YJR019C 1050 nt8.3□□□□□ -1.08
VFA1P40080 HAM1YJR069C 594 nt8.3□□□□□ -1.08
VFA1P40080 AOS1YPR180W 1044 nt8.3□□□□□ -1.08
VFA1P40080 SGF73YGL066W 1974 nt8.3□□□□□ -1.08
VFA1P40080 ATP2YJR121W 1536 nt8.29□□□□□ -1.08
VFA1P40080 PMU1YKL128C 888 nt8.28□□□□□ -1.08
VFA1P40080 RSC4YKR008W 1878 nt8.28□□□□□ -1.08
VFA1P40080 YIL168WYIL168W 384 nt8.27□□□□□ -1.09
VFA1P40080 MFT1YML062C 1179 nt8.27□□□□□ -1.09
VFA1P40080 PDC5YLR134W 1692 nt8.27□□□□□ -1.09
VFA1P40080 PEX28YHR150W 1740 nt8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63.1 ms