Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMA4P25789 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSMA4P25789 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSMA4P25789 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PSMA4P25789 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PSMA4P25789 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms