Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MEGF11A6BM72 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEGF11A6BM72 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MEGF11A6BM72 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MEGF11A6BM72 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEGF11A6BM72 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms