Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VPREB3Q9UKI3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VPREB3Q9UKI3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms