Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CGGBP1Q9UFW8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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