Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
INPP4AQ96PE3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
INPP4AQ96PE3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms