Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNE4Q8N205 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNE4Q8N205 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms