Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CRIP3Q6Q6R5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms