Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
HIF1AQ16665 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HIF1AQ16665 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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