Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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EXT1Q16394 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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