Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCSO14618 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCSO14618 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCSO14618 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCSO14618 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCSO14618 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCSO14618 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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