Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BHMG1C9JSJ3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BHMG1C9JSJ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms