Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARFGEF2Q9Y6D5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms