Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC63Q05C16 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC63Q05C16 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms