Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2E1P29083 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2E1P29083 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms