Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BHMG1C9JSJ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms