Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRIP3Q6Q6R5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRIP3Q6Q6R5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms