Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPRYD3Q8NCJ5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms