Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3C1V9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3C1V9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3C1V9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3C1V9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3C1V9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3C1V9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms