Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EEA1Q15075 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EEA1Q15075 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
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