Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PHKA1P46020 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms