Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LAD1O00515 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LAD1O00515 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LAD1O00515 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms