Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMCO3A2RU48 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMCO3A2RU48 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms